O acordo que regula a presença da UNRWA em Jerusalém data de 1967. Naquele ano, após a Guerra dos Seis Dias, Israel anexou diversos territórios, incluindo a Faixa de Gaza e a Península do Sinai, então controlados pelo Egito (esta última foi devolvida em 1979), a Cisjordânia, então controlada pela Jordânia, e as Colinas de Golã, da Síria.